Haplogrup L-M20 insanlarda görülen bir Y-DNA haplogrubudur. Tek nükleotid polimorfizminde M11, M20, M61 ve M185 farklılıkları bulunmaktadır. K Haplogrubunun ikincil soyundan gelen L-M20, LT Haplogrubunun ana koludur. L haplogrubunun alternatif filogenetik adı K1a'dır. Belucistan (28%), Kuzey Afganistan (25%) ve Güney Hindistan (19%) başta olmak üzere Güney Asya'da, Tacikistan'da ve Anadolu'da da görülen bu haplogruba, İran'da da düşük yoğunlukta rastlanmaktadır. Ayrıca, binlerce yıldır Kafkasya, Avrupa ve Orta Asya'da da bu haplogrup çok düşük yoğunlukta görülmektedir.
L-M20, K-M9 Haplogrubundan türeyen LT Haplogrubundan türemiştir.[1][2][2][3] Doktor Spencer Wells'e göre, L-M20 Tacikistan'daki Pamir Dağları bölgesinde ortaya çıkmış ve MÖ 30.000 yılında Pakistan ve Hindistan bölgesine gelmiştir.[4][5][6] Bununla beraber, diğer çalışmalarında çoğu, L-M20'nin Batı Asya kökenli olduğunu ve neolitik çiftçilerin yararlandığı İndus Nehri aracılığıyla diğer bölgelere yayıldığını göstermektedir.[7][8][9][10][11][12] 2024 yılında yayımlanan çalışmada, bilinen aksine haplogrubun 20.600 yıl önce Batı Asya'da ortaya çıktığı, MÖ 4. binyılda Güney Asya'ya yayıldığı tespit edildi.[13]
^Mahal, David G.; Matsoukas, Ianis G. (20 Eylül 2017). "Y-STR Haplogroup Diversity in the Jat Population Reveals Several Different Ancient Origins". Frontiers in Genetics. Cilt 8. s. 121. doi:10.3389/fgene.2017.00121. ISSN1664-8021. PMC5611447 $2. PMID28979290.
^Spencer Wells (2003), The Journey of Man. A Genetic Odyssey. New Delhi: Penguin Books India, p. 167
^Zhao, Zhongming; Khan, Faisal; Borkar, Minal; Herrera, Rene; Agrawal, Suraksha (2009). "Presence of three different paternal lineages among North Indians: A study of 560 Y chromosomes". Annals of Human Biology. 36 (1). ss. 46-59. doi:10.1080/03014460802558522. ISSN0301-4460. PMC2755252 $2. PMID19058044.
^Thanseem, Ismail; Thangaraj, Kumarasamy; Chaubey, Gyaneshwer; Singh, Vijay Kumar; Bhaskar, Lakkakula VKS; Reddy, B Mohan; Reddy, Alla G; Singh, Lalji (7 Ağustos 2006). "Genetic affinities among the lower castes and tribal groups of India: inference from Y chromosome and mitochondrial DNA". BMC Genetics. Cilt 7. s. 42. doi:10.1186/1471-2156-7-42. ISSN1471-2156. PMC1569435 $2. PMID16893451.
^Cordaux, Richard; Aunger, Robert; Bentley, Gillian; Nasidze, Ivane; Sirajuddin, S. M.; Stoneking, Mark (3 Şubat 2004). "Independent origins of Indian caste and tribal paternal lineages". Current Biology. 14 (3). ss. 231-235. doi:10.1016/j.cub.2004.01.024. ISSN0960-9822. PMID14761656.
^McElreavey, K.; Quintana-Murci, L. (2005). "A population genetics perspective of the Indus Valley through uniparentally-inherited markers". Annals of Human Biology. 32 (2). ss. 154-162. doi:10.1080/03014460500076223. ISSN0301-4460. PMID16096211.
^Thangaraj, Kumarasamy; Naidu, B. Prathap; Crivellaro, Federica; Tamang, Rakesh; Upadhyay, Shashank; Sharma, Varun Kumar; Reddy, Alla G.; Walimbe, S. R.; Chaubey, Gyaneshwer; Kivisild, Toomas; Singh, Lalji (20 Aralık 2010). "The Influence of Natural Barriers in Shaping the Genetic Structure of Maharashtra Populations". PLoS ONE. 5 (12). ss. e15283. Bibcode:2010PLoSO...515283T. doi:10.1371/journal.pone.0015283. ISSN1932-6203. PMC3004917 $2. PMID21187967.
^Liu SH, N, Yilihamu, R Bake, et al. (2018), "A study of genetic diversity of three isolated populations in Xinjiang using Y-SNP." Acta Anthropologica Sinica, 2018, 37(1): 146-156.