Fenerbahçe (basketbol takımı) 1979-80 sezonunda bir sezon önce küme düşmenin kaldırılmasıyla 14 takıma yükselen Türkiye Basketbol Ligi'nde on birinci oldu.
Yıldız takım İstanbul Ligi'nde İTÜ'nün ardından İstanbul ikincisi oldu.
20-24 Nisan 1980 tarihlerinde düzenlenen Türkiye Yıldız Erkekler Basketbol Şampiyonası'na katılan sarı-lacivertli takım yarı finalde elense de, üçüncülük maçında İstanbul şampiyonluğunu kaybettiği İTÜ'den rövanşı 37-36'lık sonuçla aldı ve Türkiye üçüncüsü oldu. Bu maçta, İTÜ'lü basketbolcu Uğur'un antrenörü Can Sever'in yanlış yönlendirmesiyle kendi potasına attığı turnike basketle Fenerbahçe 2-0 öne geçti. Karşılaşma 37-36 Fenerbahçe'nin galibiyetiyle bitince, bu hatalı basket maçın sonucuna etki etmiş oldu.